長所
単気筒エンジンは、多気筒エンジンと比べると部品数が少なく構造が単純であり整備性が良い。また、同排気量の多気筒エンジンと比べた場合、軽量かつ小型にする事が出来る。
部品数を少なくできるメリットは多気筒エンジンでも同じことが言え、同じ排気量でも6気筒より4気筒、8気筒より6気筒の方が部品の数は少なくなる。
短所
単気筒エンジンは、同排気量の多気筒エンジンと比べた場合、最大回転数を低くせざるを得ないことから、結果として出力が小さくなる。
また、多気筒エンジンであればピストン同士の慣性力を相殺できるが、単気筒ではそれが無理なため、振動が大きいといった欠点もある。
用途
単気筒エンジンは、単位排気量あたりの出力をあまり求められない用途について適している。たとえば、小型の汎用エンジン・小型のポータブル発電機・小型の船外機などには単気筒エンジンが使われることが多い。
バイクでは、軽量性を求められる小排気量オフロードタイプの車種は殆どが単気筒エンジンであるほか、オンロードタイプにおいても軽量性や独特の出力特性・操作感などから単気筒エンジンを搭載する車種に一定の人気がある。50cc未満の原動機付自転車やミニカーに搭載されているエンジンは、ほとんどが単気筒エンジンである。